3月，美國《新英格蘭醫(yī)學雜志》主編、美國哈佛大學呼吸科的知名教授Jeffrey M. Drazen應邀來我院交流訪問。
4月，王杉任院長。
5月，舉行王晶烈士銅像揭幕儀式。
9月，陳紅接任黨委書記。
9月，由北京大學人民醫(yī)院、涼山州醫(yī)學會、涼山州第一人民醫(yī)院共同主辦的“2006·西部醫(yī)學論壇”于在涼山州首府西昌市舉行。
10月，由祝學光教授牽頭并主持《外科學》榮獲2006年國家級教學精品課程，實現(xiàn)了北京大學人民醫(yī)院、北京大學醫(yī)學部在這個獎項上“零”的突破。
12月，邀請四川大學華西醫(yī)院的管理層各級領導和專家，主持召開了“2006·現(xiàn)代醫(yī)院管理論壇”。
12月，我院教職員工奉獻愛心，募捐援助因病輟學的彝族孤殘少年馬秀才，把他接到北京進行脊柱側彎矯形手術，手術獲得了極大的成功。馬秀才完全康復，重返家鄉(xiāng)。

 

4月，舉行王晶烈士骨灰安放儀式。
4月21日至5月6日，我院發(fā)現(xiàn)一例SARS疑似病例，迅速啟動非典防治預案，將病人及家屬轉入地壇醫(yī)院。西城區(qū)衛(wèi)生局對我院呼吸科病區(qū)進行就地檢疫、隔離觀察。5月6日，解除醫(yī)學觀察，醫(yī)務人員0感染率。
6月，新病房樓奠基。
8月10日，北京大學器官移植中心于我院成功實施的首例心臟移植手術。
9月，醫(yī)院承擔北京大學醫(yī)學部八年制臨床教學。
12月，受衛(wèi)生部和商務部委托，成功協(xié)辦首屆非洲國家醫(yī)院院長研修班，共有來自25個非洲國家的30多位醫(yī)院院長參加了課程學習。

 

2月3日，我院心內科成功為一名患者植入國內首例長時程心律失常捕捉儀——植入性心電圖記錄器。
7月，成立生殖醫(yī)學中心。
9月，我國首家臍帶血造血干細胞庫成立，陸道培院士任主任。