東部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院組建于2018年11月，以原南京軍區(qū)南京總醫(yī)院、原第八十一醫(yī)院（含八十六臨床部）、原第八十二醫(yī)院（含一四九臨床部）、原第三五九醫(yī)院為基礎(chǔ)，納入駐寧及周邊地區(qū)機關(guān)院校15家門診部。
醫(yī)院現(xiàn)擁有國家、軍隊、軍區(qū)和江蘇省重點學(xué)科34個。擁有2名中國工程院院士、1名長江學(xué)者、4名百千萬人才工程人選。先后有49人獲得政府特殊津貼，17人次獲得“何梁何利獎”“國家突出貢獻中青年專家”“國家杰出青年基金”等重大獎項。
醫(yī)院醫(yī)療設(shè)備國際一流，擁有術(shù)中放療機、“達芬奇”手術(shù)機器人、雙源CT、射波刀、PET/CT等現(xiàn)代化醫(yī)療設(shè)備。推行“醫(yī)院管理智能化、醫(yī)療信息數(shù)字化、機關(guān)辦公自動化、衛(wèi)勤保障精確化”，信息化水平全國一流，是全軍首批數(shù)字化示范醫(yī)院。處于國際領(lǐng)先的技術(shù)有：腎臟疾病一體化診斷治療技術(shù)；肝腸脾多臟器聯(lián)合移植（亞洲首例）；復(fù)雜性腎臟病的中西醫(yī)結(jié)合治療；腦垂體移植（國際首例）；小腸移植（亞洲首例）；腸外瘺的治療等。
醫(yī)院著眼全面提升遂行多樣化軍事任務(wù)衛(wèi)勤保障能力，加強戰(zhàn)備質(zhì)量建設(shè)，完善綠色救治通道，近年來出色完成了利比里亞維和、海地救援、贊比亞軍援以及9.14湯山毒鼠強中毒、8.9氯氣中毒、5.25重大交通事故、7.28南京爆炸事件、5.12汶川抗震救災(zāi)、8.2昆山爆炸事故等國際國內(nèi)維和救援任務(wù)。
醫(yī)院先后被表彰為“全國百佳醫(yī)院”“全國擁政愛民模范單位”“全軍為部隊服務(wù)先進醫(yī)院”“全軍國家級應(yīng)急專業(yè)力量建設(shè)先進單位”等，“研究型醫(yī)院”建設(shè)的經(jīng)驗被中宣部列為重大典型宣傳。涌現(xiàn)出全國重大典型“矢志報國為民的優(yōu)秀共產(chǎn)黨員”,“勝利功勛榮譽”獲得者黎介壽院士、南丁格爾獎獲得者陳聲容等先進典型。
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